玉米多组学数据库欲买通信息“孤岛”(2)

严建兵进一步表明说：“我们收集、整合的同时，还做了许多关联阐明。假如你做了基因组学的尝试，那么通过与代谢组学或遗传组学的功效比对，可以磨练你的结论受到支持照旧阻挡。对付入门研究者来说，可以清晰明白地看到，其他学者已经做过哪些相关研究。”

也就是说，该数据库可以辅佐学者直观相识到，他们感乐趣的基因与四周的哪些遗传变异有关联，同时也可以按照这些遗传变异和相关表型的遗传定位功效，去寻找大概的遗传变异 基因表达 表型改变之间的干系。

据不完全统计，已有高出60个海表里尝试室所利用严建兵课题组资源，发生了一大批基本研究成就。“即便不是我们本身产出的成就，可是数据和种质资源的分享，对付农作物的遗传改善、作物育种很是重要。”严建兵认为，其他学者操作这些资源做出了更优秀的研究成就，对整个玉米研究规模的成长都长短常有益的。

而对付由中国粹者成立生物组学数据库的须要性，李林提及一次事件。去年上半年，由于美国当局预算未被国会核准，美国当局相关机构停摆，美国玉米基因组和遗传学数据库（）被关停，导致研究者无法实时获取完整数据。雷同事件远不止于此。

“学界缺乏可以或许真正处事于中国作物学研究的数据库。”李林强调，“假如可以或许具有多样化的选择，那对数据安详、研究的利便水平城市更有利。”

维护更待持之以恒

李林也正在实验在他的规模成立网络大数据库，深知个中不易：“大数据时代，信息许多也很全面，但同时也会带来噪音，整合起来很是贫苦，严建兵课题组是通过10年积聚、多位研究人员、研究生接力实现的。而数据库搭建完成后，对其维护更新也是件持之以恒的事。”

对此，严建兵坦陈，在国际上一些成熟数据库会有专职人员举办维护，从几人到几百人的局限都有。而海内无论从项目体系照旧评价体系，都临时没有相应支持，做数据库只能靠兼职。“研究人员搭建数据库，不只要具备深度的专业常识，可以或许对基因、转录、卵白等组学的数据等举办挖掘阐明，还要对计较机语言、数据库搭建法则等有所把握。”

从另一个角度看，搭建生物组学数据库，不只是促进科学事业成长的公益性事情，同时也是造就交错学科人才的进程。第一位辅佐严建兵从零开始搭建数据库的博士研究生刘水师，今朝已经在奥地利科学院格雷戈尔·孟德尔研究所从事博士后研究。

桂松涛打仗生组学数据库事情一年半时间，钻研了很多搭建东西，从做尝试逐步转到做生物信息，经验了收获也经验了很多实验和妥协。

“搭建数据库与传统科研事情有很大不同，不只要办理技能上的问题，还要思量展示逻辑，思量用户对数据的相识水平，以及用户体验。数据库平台在简朴、直观、易用的同时，最好还要只管雅观。”桂松涛说。

“我们等候这一云端集成检索，能有效促进现有玉米组学数据资源的操作率，辅佐科学家深入领略玉米遗传变异、表型和基因之间的干系，帮助玉米的遗传育种和改善。”严建兵团队已经发出邀请，等候学者们上传数据，配合完善该数据库。

相关论文信息：https://doi.org/10.1016/ j.isci.2020.101241

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