疫情中的科研突击队

 
 
疫情中的科研突击队  
——记中科院上海巴斯德研究所疫情防控科技攻关  

中科院上海巴斯德研究所科技攻关组科研人员正在开展工作。中科院上海巴斯德研究所供图

■本报记者 倪思洁

1月27日，大年初三，中国科学院上海巴斯德研究所（以下简称上海巴斯德所）党员、研究员郝沛走进所里。单位保安给她测好体温后，他们互道了声“新年好”。在新型冠状病毒疫情蔓延的新年里，这是郝沛经历的第一个面对面的拜年。

之后，她走进研究所大楼，和上海巴斯德所科研骨干一起，在科技攻关《请战书》上，签上了自己的名字。

《请战书》里这样写道：“我们愿为战胜新型冠状病毒疫情随时听候调遣，我们全体队员都义无反顾！”

疫情里的科技之声

郝沛等科研人员对新出现的病毒产生警觉，是在1月12日的下午。就在此前，我国研究人员在国外数据库公布了新型冠状病毒基因组序列。从1月11日下午开始，郝沛和研究团队的科研人员们一起，开始对数据进行生物信息学分析。熬了整整一个通宵后，他们终于在1月12日的下午看到了数据结果。

“通过对武汉的新型冠状病毒spike蛋白的结构模拟计算，预测新型冠状病毒spike蛋白可以与人ACE2蛋白结合，可能通过该机制感染人体上呼吸道表皮细胞。”郝沛拿着数据结果与冠状病毒领域的大专家商量。

大家一致认为，他们手中的分析数据可以为其他科研人员提供学术参考，也可以为科研人员了解此次病毒的起源、原生宿主，以及评估病毒在物种间或人类之间公共传播的风险提供帮助。于是，他们及时将数据共享了出去。

随着病毒感染样本二代测序数据大量产出，郝沛等人开始考虑是否可以将自己的未知病毒分析流程共享，以便更便捷、系统地了解病毒情况。于是，他们与中国科学院上海营养与健康研究所合作，建立起病毒基因组自动化鉴定云平台（VIC）。

“我们希望能够用擅长的生物信息学技术，协助医院机构很快作出专业判断。”郝沛说。

这一平台可以直接对接人体样本的RNA二代测序原始数据，具有对数据全自动质量控制、拼接和病毒组成分析等功能，能够用来全面分析患者的呼吸道病毒组，研究其致病因子，助力临床诊断，为采用相应的治疗措施提供参考，同时还可以监测病毒变异趋势，以便提前部署应对措施。

与时间和疫情赛跑

因为疫情形势严峻，郝沛没有让她研究团队里的科研人员到所里上班。“上下班往返的路上会有感染的风险，我们做生物信息数据分析，是可以在家里办公的。”郝沛说。可是，她自己却从大年初三开始，每天到研究所工作，随时准备为研究团队做各种协调工作。

从春节前至今，无论是做数据分析，还是建立“病毒基因组自动化鉴定云平台”，他们的工作一直没有停过。因为他们知道，疫情不会等人。

和郝沛研究团队一样，整个上海巴斯德所都在与疫情和时间赛跑，因为这是嵌在这个研究所骨子里的使命。

2003年非典疫情之后，中科院党组开始着手组织能够对抗传染病的科研力量，酝酿成立专门的研究所。

从诞生之日起，这个研究所就担负起了抗疫的使命——聚焦病原微生物基本生命活动规律、重大传染性疾病的致病机制等关键科学问题，为公共卫生与生物安全提供科技支撑和解决方案。十多年来，上海巴斯德所随时准备在国家和人民需要的时候，冲上疫情防控和科技攻关的第一线。

做科技攻关排头兵